公司还有债务可以申请破产吗

可以。
根据《民事诉讼法》规定:无力清偿到期债务,债务人可以向人民法院申请宣告破产还债。
此外,根据《企业破产法(试行)》规定:债务人经其上级主管部门同意后,可以申请宣告破产。
依据最高人民法院《关于审理企业破产案件若干问题的规定》:申请(被申请)破产的债务人应当具备法人资格,不具备法人资格的企业、个体工商户、合伙组织、农村承包经营户不具备破产主体资格。
《破产法司法解释》第九条
申请人向人民法院提出破产申请,人民法院未接收其申请,或者未按本规定第七条执行的,申请人可以向上一级人民法院提出破产申请。
上一级人民法院接到破产申请后,应当责令下级法院依法审查并及时作出是否受理的裁定;下级法院仍不作出是否受理裁定的,上一级人民法院可以径行作出裁定。
上一级人民法院裁定受理破产申请的,可以同时指令下级人民法院审理该案件。